Metaheuristics based de novo protein sequencing: A new approach

peer-reviewed · Applied Soft Computing · 2011

peer-reviewed · Applied Soft Computing · 2011. Jean-Charles Boisson et al.
Date 2011-03-01
Type peer-reviewed
Venue Applied Soft Computing
Publisher Elsevier BV
Contribution algorithm
DOI 10.1016/j.asoc.2010.08.007
Citations (OpenAlex) 2

Authors

  1. Jean-Charles Boisson · Centre Inria de l’Université de Lille, Institut national de recherche en sciences et technologies du numérique, LIFL / INRIA, Laboratoire d’Informatique Fondamentale de Lille, Université de Lille
  2. Laetitia Jourdan · Centre Inria de l’Université de Lille, Institut national de recherche en sciences et technologies du numérique, LIFL / INRIA, Laboratoire d’Informatique Fondamentale de Lille, Université de Lille
  3. El-Ghazali Talbi · Centre Inria de l’Université de Lille, Institut national de recherche en sciences et technologies du numérique, LIFL / INRIA, Laboratoire d’Informatique Fondamentale de Lille, Université de Lille

Methods and tools

  • Adaptive GA for tandem-MS peptide sequencing: Adaptive genetic algorithm for protein sequencing from tandem MS. Represents peptides as GA individuals, evolves them against the observed spectrum; the adaptive component tunes mutation / crossover rates on the fly.

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